| Nombre del grupo de investigación | Institución a la que pertenece | Responsable(s)/Investigador/a(es) Principal(es) | URL institución |
| Plataforma de Proteómica del CIC bioGUNE | CIC bioGUNE | Felix Elortza | https://www.cicbiogune.es/ |
| URL grupo: https://www.cicbiogune.es/research/platforms/proteomic | |||
Descripción |
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| La Plataforma de Proteómica del CIC bioGUNE cuenta con más de 20 años de experiencia en el campo de la proteómica. Nuestra labor se centra en desarrollar, adecuar e implementar en nuestro laboratorio metodologías y técnicas para hacer frente a los nuevos retos de la proteómica en sus diferentes variantes. Nuestros usuarios y colaboradores provienen de diversas entidades incluyendo empresas, centros tecnológicos, universidades y centros de investigación. Aplicamos la espectrometría de masas a diferentes tipos de estudios proteómicos y de caracterización de proteínas. Tenemos amplia experiencia en el análisis de péptidos y proteínas mediante MALDI-TOF. Nuestro sistema de cromatografía líquida a escala nano acoplada a espectrometría de masas en tándem, EVOSEP-Tims TOF Pro (Bruker), nos permite abordar estudios proteómicos con un alto nivel de robustez, sensibilidad y precisión. Dada la transversalidad la espectrometría de masas, podemos abordar diferentes tipos de análisis: a) Caracterización de péptidos endógenos en biofluidos (p.e. lágrima y fluido endometrial); b) Cuantificación diferencial relativa sin marcaje de proteomas complejos (extractos celulares, tisulares y biofluidos; preparaciones de vesículas extracelulares, inmunoprecipitaciones etc.); c) Nuestros sistema nLC MS/MS y protocolos optimizados nos permiten hacer frente a proyectos de gran envergadura (cientos de muestras); d) Análisis de modificaciones post-traduccionales en muestra compleja como p.e. fosforilación; e) Caracterización detallada de la glicosilación en proteínas purificadas: determinación de sitios de N-glicosilación, análisis de micro-heterogeneidad y cuantificación relativa de isoformas. | |||
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Publicaciones de interés (últimos 10 años) |
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| ⇒ | Cullin-RING ligase BioE3 reveals molecular-glue-induced neosubstrates and rewiring of the endogenous Cereblon ubiquitome. Merino-Cacho L, Barroso-Gomila O, Pozo-Rodríguez M, Muratore V, Guinea-Pérez C, Serrano Á, Pérez C, Cano-López S, Urcullu A, Azkargorta M, Iloro I, Galdeano C, Juárez-Jiménez J, Mayor U, Elortza F, Barrio R, Sutherland JD. Cell Commun Signal. 2025 Feb 19;23(1):101. doi: 10.1186/s12964-025-02091-5 | ||
| ⇒ | Quintana JI, Delgado S, Rábano M, Azkargorta M, Florencio-Zabaleta M, Unione L, Vivanco MD, Elortza F, Jiménez-Barbero J, Ardá A. The impact of glycosylation on the structure, function, and interactions of CD14. Glycobiology. 2024 Apr 1;34(3):cwae002.2023 Nov 23;14(1):7656. | ||
| ⇒ | The PP2A regulator IER5L supports prostate cancer progression. Crespo JR, Martín-Martín N, Garcia-Longarte S, Corres-Mendizabal J, Carlevaris O, Astobiza I, Zabala-Letona A, Guiu M, Azkargorta M, Gonzalez-Lopez M, Macías-Cámara N, Doan P, Elortza F, Mendizabal I, Westermack J, Gomis RR, Ercilla A, Carracedo A. Cell Death Dis. 2024 Jul 18;15(7):514. doi: 10.1038/s41419-024-06907-z. | ||
| ⇒ | Lapitz A, Azkargorta M, et al. Liquid biopsy-based protein biomarkers for risk prediction, early diagnosis, and prognostication of cholangiocarcinoma. J Hepatol. 2023 Mar 1:S0168-8278(23)00159-9. doi: 10.1016/j.jhep.2023.02.027 | ||
| ⇒ | Azkargorta M, Bregón-Villahoz M, Escobes I, Ibáñez-Pérez J, Iloro I, Iglesias M, Diez-Zapirain M, Rabanal A, Prieto B, Moragues MD, Matorras R, Elortza F. In-depth proteomics and natural peptidomics analyses reveal antibacterial peptides in human endometrial fluid. J Proteomics. 2020. Mar 30;216:103652. doi: 10.1016/j.jprot.2020.103652. | ||
